Аркнайтс: Прелюдия к рассвету

События аниме разворачиваются на планете Терра, которая во многом напоминает Землю, но отличается необычными обитателями. Живые существа этого мира имеют черты различных животных, а также обладают способностью использовать особую магию, известную как Искусство Оригиниума. Однако жизнь на Терре далека от спокойной: планету регулярно поражают масштабные Катастрофы, вынуждающие целые народы покидать свои дома и искать безопасные места для существования. Именно эти разрушительные события стали причиной появления нового опасного заболевания под названием Орипатия. Болезнь быстро распространяется и практически всегда приводит к смерти заражённых. Из-за высокой угрозы инфицированных начинают бояться и отвергать, а общество постепенно превращает их в изгоев. Больных изгоняют из городов, пытаясь защитить остальных жителей от заражения.

Главным героем истории становится загадочный человек, известный как Доктор. После неизвестного происшествия он потерял память и не способен вспомнить своё прошлое. Несмотря на это, он сохраняет выдающиеся знания и навыки, благодаря которым становится одним из руководителей организации «Остров Родос». Эта фармацевтическая компания занимается поиском лечения Орипатии и помогает тем, кого общество отвергло. Однако деятельность организации не ограничивается медициной. Её сотрудники вынуждены противостоять группировкам заражённых, которые, пережив преследования и жестокое обращение, решили объявить войну правительству и всему миру. Доктору и его союзникам предстоит не только бороться с последствиями страшной болезни, но и разобраться в причинах конфликта между заражёнными и здоровыми. В мире, где страх и ненависть разделяют людей, им предстоит найти путь к спасению и доказать, что даже самые тяжёлые обстоятельства не должны лишать кого-то права на жизнь.